Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Upf2A2AT37 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Upf2A2AT37 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Upf2A2AT37 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms