Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef17A2ASJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramef17A2ASJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pramef17A2ASJ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms