Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubb1A2AQ07 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubb1A2AQ07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubb1A2AQ07 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms