Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
AI481877A2ALV5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AI481877A2ALV5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
AI481877A2ALV5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
AI481877A2ALV5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms