Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VirmaA2AIV2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VirmaA2AIV2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VirmaA2AIV2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VirmaA2AIV2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms