Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Frmpd4A2AFR3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Frmpd4A2AFR3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Frmpd4A2AFR3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms