Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Prdm2A2A7B5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm2A2A7B5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prdm2A2A7B5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms