Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calcoco2A2A6M5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calcoco2A2A6M5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calcoco2A2A6M5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms