Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6268A2A3U9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm6268A2A3U9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm6268A2A3U9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms