Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trav12-2A0N8N6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trav12-2A0N8N6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms