Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap99A0A140LIX9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap99A0A140LIX9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap99A0A140LIX9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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