Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0U1RNP2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0U1RNP2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0U1RNP2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms