Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms