Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Trbv21A0A0A6YX06 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Trbv21A0A0A6YX06 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Trbv21A0A0A6YX06 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Trbv21A0A0A6YX06 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Trbv21A0A0A6YX06 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Trbv21A0A0A6YX06 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Trbv21A0A0A6YX06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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Trbv21A0A0A6YX06 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trbv21A0A0A6YX06 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Trbv21A0A0A6YX06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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