Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Krt27Q9Z320 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Krt27Q9Z320 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms