Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms