Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs4Q9Z1T2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms