Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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VarsQ9Z1Q9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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VarsQ9Z1Q9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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VarsQ9Z1Q9 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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VarsQ9Z1Q9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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VarsQ9Z1Q9 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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VarsQ9Z1Q9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VarsQ9Z1Q9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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