Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR1

Sec61a2, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 2, mousemouse

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a2Q9JLR1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61a2Q9JLR1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61a2Q9JLR1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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