Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tlr5Q9JLF7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms