Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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