Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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