Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pdzd9Q9D9M4 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pdzd9Q9D9M4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pdzd9Q9D9M4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pdzd9Q9D9M4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pdzd9Q9D9M4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Pdzd9Q9D9M4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd9Q9D9M4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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