Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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