Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ifi35Q9D8C4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms