Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp5Q9D7S9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms