Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Capns2Q9D7J7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Capns2Q9D7J7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Capns2Q9D7J7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms