Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Shisa5Q9D7I0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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