Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ribc2Q9D4Q1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms