Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Spns3Q9D232 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Spns3Q9D232 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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