Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms