Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nip7Q9CXK8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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