Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Sgo1Q9CXH7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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