Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Psma8Q9CWH6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Psma8Q9CWH6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Psma8Q9CWH6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Psma8Q9CWH6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Psma8Q9CWH6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Psma8Q9CWH6 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Psma8Q9CWH6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Psma8Q9CWH6 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Psma8Q9CWH6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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