Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms