Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smurf1Q9CUN6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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