Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms