Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpl17Q9CPR4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms