Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Prpf19Q99KP6 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Prpf19Q99KP6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Prpf19Q99KP6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Prpf19Q99KP6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Prpf19Q99KP6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Prpf19Q99KP6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prpf19Q99KP6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prpf19Q99KP6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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