Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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TrabdQ99JY4 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TrabdQ99JY4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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