Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Depp1Q8K2F3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Depp1Q8K2F3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Depp1Q8K2F3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Depp1Q8K2F3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Depp1Q8K2F3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Depp1Q8K2F3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Depp1Q8K2F3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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