Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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