Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms