Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc38Q8CDN8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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