Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nsun3Q8CCT7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms