Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntrobQ8CB62 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CntrobQ8CB62 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms