Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp20Q8C6M1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp20Q8C6M1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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