Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc30Q8BVF4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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