Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Slc5a7Q8BGY9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Slc5a7Q8BGY9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Slc5a7Q8BGY9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Slc5a7Q8BGY9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Slc5a7Q8BGY9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Slc5a7Q8BGY9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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