Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc50Q810U5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc50Q810U5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms